More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1269 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  100 
 
 
134 aa  277  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  67.91 
 
 
137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  67.91 
 
 
137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  67.91 
 
 
137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  69.4 
 
 
136 aa  208  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1642  acyl-CoA thioester hydrolase YciA  63.43 
 
 
137 aa  187  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0172566  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2146  thioesterase family protein  63.43 
 
 
137 aa  184  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  59.54 
 
 
139 aa  167  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  51.79 
 
 
145 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
139 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  55.26 
 
 
157 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  51.79 
 
 
145 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
166 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 
133 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 
136 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 
136 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 
136 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  51.79 
 
 
132 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  51.35 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  51.79 
 
 
228 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  47.5 
 
 
169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  47.41 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  48.33 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  50 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
131 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  50.43 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  50.43 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  50.43 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  50.91 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  50.91 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  48.72 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  51.24 
 
 
154 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  47.54 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  47.46 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  47.83 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  47.75 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  45.83 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  47.46 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  50.45 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  49.54 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
154 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  48.67 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  45.45 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  49.11 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
150 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
146 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.484211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
158 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  41.46 
 
 
143 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  44.07 
 
 
132 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  43.48 
 
 
126 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  43.48 
 
 
126 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  45.53 
 
 
134 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
129 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
149 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
150 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
128 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
145 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 
155 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
132 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
126 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
134 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
143 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 
139 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6721  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
149 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0422424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 
139 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>