More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0936 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 172 aa  340  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0878  thioesterase superfamily protein  90.7 
 
 		 172 aa  278  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 		 171 aa  194  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  69.57 
 
 		 248 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  53.12 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  55.95 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  44.67 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.42 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  38.78 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  42.77 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  38.99 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  42.57 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  38.99 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  40.13 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  41.77 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.74 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  40.14 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  39.46 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.08 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.85 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.16 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  37.18 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  44.54 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  33.97 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.4 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  37.65 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.15 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  46.4 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  41.26 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  34.46 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  35 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 169 aa  90.9  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.03 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  41.56 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  36.49 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  29.3 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.11 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.11 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  41.29 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.48 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  36.48 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  36.48 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  45.61 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.48 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.48 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.48 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.85 
 
 		 168 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  34.9 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  40.35 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  32.19 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  38.13 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  42.11 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  42.11 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.11 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  42.11 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.11 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>