More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1397 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 172 aa  343  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  55.83 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 		 248 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  53.12 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0878  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  49.38 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  42 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  43.14 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  41.55 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  42.48 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  40.25 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  37.28 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  39.49 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  40.76 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  44.08 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  45.58 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  38.56 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.86 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  41.94 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  34.23 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  36.11 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  38.89 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  39.44 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  40.15 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  38.73 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  36.43 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  34.36 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.15 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  50.79 
 
 		 176 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 171 aa  91.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.96 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 162 aa  88.2  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  40.68 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  39.83 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  41.29 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.88 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.88 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.25 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.37 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  32.89 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.51 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  34.73 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  35.33 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  34.73 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  34.73 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  30.87 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>