More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0172 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  64.33 
 
 		 314 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  66.56 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  61.36 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  29.64 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  26.01 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  29.44 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.55 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  34.19 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  35.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  35.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  44.44 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  34.48 
 
 		 170 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 167 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  44 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  34.48 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 161 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  40.37 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.72 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 160 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  36.28 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 133 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.81 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  34.53 
 
 		 169 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 167 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.81 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  33.59 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  25.33 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  33.96 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  31.72 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.3 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.82 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 171 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.56 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  35.48 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 129 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  35.65 
 
 		 173 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.23 
 
 		 180 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  38.32 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  32.59 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  33.87 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  34.78 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 119 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 160 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  33.86 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>