More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1253 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
334 aa  671    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  74.6 
 
 
341 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  67.42 
 
 
314 aa  430  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  61.09 
 
 
313 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  29.54 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
318 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
311 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
311 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  26.78 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  28.82 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  43.88 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
178 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  42.55 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 
160 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
122 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
178 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
180 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  34.15 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.84 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  34.35 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.64 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
167 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
167 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
161 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  33.88 
 
 
164 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  35.16 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.94 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  36.36 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  33.91 
 
 
173 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
161 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  40.23 
 
 
182 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 
170 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
122 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
180 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
161 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
168 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
161 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
147 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  30.52 
 
 
169 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
167 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  33.04 
 
 
146 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
119 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
185 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
171 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.5 
 
 
122 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
135 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
169 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
176 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 
161 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  33.91 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.52 
 
 
176 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
151 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
133 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
122 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  28.19 
 
 
164 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
171 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
131 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  30.28 
 
 
134 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 
142 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
159 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
133 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
187 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
167 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
170 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  30.28 
 
 
134 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  33.64 
 
 
176 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  33.64 
 
 
176 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>