215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1251 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  253  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  86.07 
 
 		 122 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  82.79 
 
 		 122 aa  210  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  77.87 
 
 		 122 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  77.05 
 
 		 122 aa  201  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  68.85 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  60.66 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 160 aa  146  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  52.59 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  52.59 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  51.72 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  50.86 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  52.99 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  52.14 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  47.9 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  29.06 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  29.06 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.91 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 313 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.78 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  31.82 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  30.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  33.02 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.57 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  33.02 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  27.52 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  29.27 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  29.27 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 311 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  36.84 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  36.84 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  30.97 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>