279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5279 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  279  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  94.57 
 
 		 133 aa  256  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  93.8 
 
 		 133 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  93.8 
 
 		 133 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  93.8 
 
 		 133 aa  253  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  95.28 
 
 		 131 aa  253  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  89.23 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  88.46 
 
 		 134 aa  251  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  94.49 
 
 		 131 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  86.61 
 
 		 159 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  83.59 
 
 		 160 aa  225  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  72.31 
 
 		 131 aa  207  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  66.17 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  65.35 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  56.9 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  62.71 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  54.31 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.59 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  52.94 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  49.24 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.14 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  32.73 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  35.04 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.51 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.36 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 314 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  30.33 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 328 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  32.14 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>