252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02806 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  100 
 
 		 141 aa  294  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  87.8 
 
 		 125 aa  228  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  80.6 
 
 		 135 aa  227  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  55.56 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  51.91 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  53.78 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  52.94 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  50.43 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  50.43 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  52.1 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  48.72 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  48.74 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.08 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 328 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  30.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  38.27 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.83 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  41.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  41.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  41.25 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 327 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  41.25 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  37.78 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  28.08 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  40.24 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  40.24 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>