243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2765 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  256  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  98.36 
 
 		 122 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  97.54 
 
 		 122 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  96.72 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  96.72 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  96.72 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  95.9 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  80.33 
 
 		 122 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  209  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  78.69 
 
 		 122 aa  206  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  75.41 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 159 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  56.03 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  55.17 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  53.45 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  55.56 
 
 		 125 aa  137  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 135 aa  136  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  54.7 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  51.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.86 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.48 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.25 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.71 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  30.91 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  31.13 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  34.57 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 319 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  27.1 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  27.1 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  33.04 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  30.97 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.57 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  33.75 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  28.7 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  32.94 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  35.53 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  35.53 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  34.21 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.51 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>