264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10248 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  100 
 
 
129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 
133 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 
133 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  66.14 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  64.34 
 
 
159 aa  192  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  65.35 
 
 
131 aa  191  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 
131 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 
135 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  68.5 
 
 
134 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  68.5 
 
 
134 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  65.57 
 
 
160 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  60.63 
 
 
131 aa  177  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  61.42 
 
 
150 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  60.63 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  60.63 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  66.1 
 
 
121 aa  155  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  140  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 
122 aa  140  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  50 
 
 
122 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  52.1 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  44.83 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
135 aa  124  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  52.1 
 
 
141 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
122 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  29.46 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.72 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.62 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  34.23 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.03 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  29.57 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  29.57 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
327 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
128 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.19 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  30.84 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
328 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  31.78 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  31.78 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  28.18 
 
 
176 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  28.18 
 
 
176 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
334 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  30.89 
 
 
139 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  30.43 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
341 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  30.56 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
270 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
327 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.28 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>