269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4848 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  99.25 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  98.5 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  93.8 
 
 		 135 aa  254  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  91.34 
 
 		 131 aa  245  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  90.55 
 
 		 131 aa  244  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  84.85 
 
 		 134 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  84.85 
 
 		 134 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  85.04 
 
 		 159 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  82.68 
 
 		 160 aa  223  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 131 aa  204  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  69.53 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  66.41 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  66.14 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  60.17 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  50 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  51.26 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  52.94 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 334 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.51 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  29.23 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  29.23 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  30 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  32.73 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.63 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.32 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 327 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 270 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.3 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  33.03 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>