294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5067 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  100 
 
 
131 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  99.24 
 
 
131 aa  269  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  95.28 
 
 
135 aa  253  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  92.91 
 
 
133 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  92.13 
 
 
133 aa  247  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  91.34 
 
 
133 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  91.34 
 
 
133 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  87.4 
 
 
134 aa  239  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  86.61 
 
 
134 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  85.83 
 
 
159 aa  237  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  82.81 
 
 
160 aa  228  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 
131 aa  206  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  73.02 
 
 
144 aa  200  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 
144 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  66.15 
 
 
150 aa  190  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  65.35 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  64.41 
 
 
121 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
122 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
122 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
122 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  53.45 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
122 aa  140  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  51.72 
 
 
122 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  52.94 
 
 
125 aa  130  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  51.91 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
122 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.3 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.94 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
164 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.11 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.11 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  33.64 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
313 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.56 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
319 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.14 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
334 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.09 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  30.33 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
341 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
176 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  32.14 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  30.84 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  30.84 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
327 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.68 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  29.57 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>