271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1342 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  279  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  87.2 
 
 		 125 aa  229  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  80.6 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  56.41 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  56.41 
 
 		 122 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.14 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  52.94 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  52.1 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  51.26 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  50.4 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  46.27 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  49.58 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  39.47 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.86 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.91 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  37.65 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  32.11 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  31.9 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  36.26 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  36.67 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  33.7 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  32.06 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  29.46 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  33.7 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.66 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 328 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 327 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>