69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2800 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2800  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  63.93 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  64.75 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  63.11 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  63.93 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  63.93 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  57.38 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  60.66 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4135  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5279  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0461  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4848  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.141512  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4975  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5024  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  46.55 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0551  hypothetical protein  45.69 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5067  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  43.1 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0490  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20510  acyl-CoA hydrolase  43.86 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1696  thioesterase family protein  42.74 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1342  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02806  thioesterase family protein  43.59 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0316832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3832  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4038  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10248  thioesterase family protein domain protein  40.52 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00150386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0794  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  38.66 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218996  normal  0.0133262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  26.79 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 		 327 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 311 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 313 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  25.26 
 
 		 319 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.95 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  26.5 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  26.5 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  23.15 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  23.21 
 
 		 149 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>