More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1869 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
341 aa  683    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  75.08 
 
 
334 aa  478  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  73.87 
 
 
314 aa  478  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  66.56 
 
 
313 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
311 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  29.39 
 
 
311 aa  106  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
318 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
167 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  33.56 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  40.62 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.1 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
167 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
167 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 
178 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  42.86 
 
 
153 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
178 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  32.87 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  31.03 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  31.03 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  26.64 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  34.62 
 
 
130 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  33.13 
 
 
168 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.51 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.82 
 
 
161 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.5 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.04 
 
 
122 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1159  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
122 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00426691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  34.93 
 
 
161 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
166 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
180 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
122 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
166 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.2 
 
 
122 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
145 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
148 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.78 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
122 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
170 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
143 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
154 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
151 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  29.68 
 
 
170 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
154 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
120 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.68 
 
 
170 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
154 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  33.33 
 
 
169 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
154 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.68 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  30.07 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7031  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
159 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0529505  hitchhiker  0.00000000906305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.68 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
170 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 
141 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
178 aa  63.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
174 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
155 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3041  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
122 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.957748  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1318  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
122 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1309  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
122 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.847429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1345  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
122 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
129 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
168 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
173 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.17 
 
 
170 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  33.64 
 
 
158 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
139 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
167 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  32.17 
 
 
170 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
164 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
142 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05860  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>