More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05222 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  100 
 
 		 159 aa  332  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  97.09 
 
 		 161 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  86.41 
 
 		 161 aa  197  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  92.23 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  81.55 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  80.58 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  80.58 
 
 		 160 aa  180  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  79.61 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  80.58 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  74.07 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  76.7 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  78.64 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  78.64 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  78.64 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  78.64 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  79.61 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  77.67 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  64.71 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  64.76 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  67.39 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  68.89 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  67.39 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  63.04 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  64.44 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  62.92 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  61.8 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 315 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  62.92 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 328 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  52.04 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  47.75 
 
 		 327 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  47.19 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  38.46 
 
 		 188 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  39.42 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  39.42 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  42.22 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  43 
 
 		 185 aa  84  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  42.22 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.14 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  42.53 
 
 		 182 aa  83.6  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  43.01 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  38.38 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  42.05 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  45.57 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  38.78 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  42.39 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21700  acyl-CoA hydrolase  41 
 
 		 324 aa  80.5  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  39.08 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  45.35 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  38.64 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  39.58 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  41.38 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>