112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1922 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
134 aa  263  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  40.83 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 
154 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  34.59 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  34.59 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  34.59 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  34.59 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  34.59 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  38.35 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  36.13 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  36.13 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  36.13 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  35 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  30.37 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.82 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  30.37 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  29.77 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  32.08 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  32.61 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  28.83 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  25.19 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  32 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  25.93 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.74 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  43.4 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  43.4 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  43.4 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  24.44 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  31.52 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  32.26 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  27.1 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  26.5 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  45.28 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  26.5 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  29.35 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  27.05 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  27.01 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  39.62 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.37 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.09 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 
165 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  24.39 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
137 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.01 
 
 
146 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 
148 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  33.7 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  43.4 
 
 
155 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>