200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3552 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  87.5 
 
 		 141 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  66.94 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  67.74 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  66.94 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  66.94 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  66.13 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  66.13 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  66.13 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  66.13 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  66.13 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  66.13 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  66.13 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  67.48 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  65.32 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  65.32 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 		 134 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  66.13 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  44.81 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  40.83 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  37.27 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  33.58 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  31.93 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  39.25 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  30.94 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  30.94 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  31.93 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  32.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  36.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  35.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  37.14 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  33.03 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  39.47 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.62 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  31.54 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  32.11 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 183 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  32 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  34.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  28.68 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.81 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  32.61 
 
 		 238 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  26 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  29.7 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>