More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2923 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  69.39 
 
 
147 aa  222  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  69.39 
 
 
147 aa  216  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 
153 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  55.78 
 
 
150 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  48.06 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.04 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.83 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.21 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.75 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.75 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  29.75 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.75 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  33.08 
 
 
163 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.08 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  31.76 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  28.93 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  27.48 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  31.03 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  31.03 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  32.1 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  32.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.73 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  32.03 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  30.17 
 
 
126 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
138 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  28.95 
 
 
155 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  32.04 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  26.89 
 
 
209 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
184 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  30.17 
 
 
126 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  30.17 
 
 
126 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  30.36 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  33.71 
 
 
137 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  30.93 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  31.13 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>