263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0441 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  51.77 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  50.7 
 
 		 319 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  51.39 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  46.58 
 
 		 301 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 		 167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 159 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  43.54 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  44.22 
 
 		 175 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  50.42 
 
 		 157 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  44.22 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  44.22 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  49.58 
 
 		 157 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  43.54 
 
 		 175 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  43.54 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  45.38 
 
 		 140 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  48.74 
 
 		 178 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  45.11 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  37.85 
 
 		 169 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  43.31 
 
 		 151 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  44.36 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 		 158 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  44.44 
 
 		 156 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  40.14 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  38.93 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 158 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  40.85 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  43.65 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  41.86 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 		 168 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  40.71 
 
 		 162 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 144 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  37.68 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  38.57 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 162 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  33.6 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 138 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  26.99 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.91 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  62  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.53 
 
 		 155 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  24.14 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  24.14 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  24.14 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.61 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  25.69 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  26.95 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  30.84 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  34.69 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  21.38 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  24.39 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>