296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1483 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  99.31 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  89.58 
 
 		 144 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  66.91 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  58.7 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  55.47 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  54.69 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  54.69 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  54.69 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  54.69 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  54.69 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  54.69 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  57.5 
 
 		 161 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  56.91 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  56.1 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  51.97 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  44.78 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  45.67 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  47.66 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  44.09 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  42.64 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  37.8 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.38 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  36.75 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.33 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30.33 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.33 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.69 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  28.23 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  32.54 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  32.2 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.57 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>