204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3433 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  87.5 
 
 		 138 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  62.5 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  60.99 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  60.99 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  60.99 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  65.32 
 
 		 126 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  65.32 
 
 		 126 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  65.32 
 
 		 126 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  65.32 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  65.32 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  65.32 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  61.43 
 
 		 153 aa  173  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  65.32 
 
 		 134 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 		 134 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  59.57 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  59.57 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  65.32 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  62.79 
 
 		 134 aa  166  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  38.35 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  39.45 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  35.29 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  34.07 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.54 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  31.09 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  34.45 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  31.09 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.45 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  31.71 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  34.62 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  34.07 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.89 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  34.07 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  32.17 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  37.66 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  24.14 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  28.04 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  34.94 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.03 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  29.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  33.03 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.17 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  32.95 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  26.96 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>