182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1857 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
122 aa  247  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.31 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.3 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.72 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 
139 aa  57  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  28.85 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  36.17 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  35.16 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.73 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  34.19 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.73 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  34.58 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  30.68 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.7 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  38.78 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  29.91 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
232 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.81 
 
 
160 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
154 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  27.19 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.79 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  27.19 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.85 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  27.19 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.63 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.19 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  26.97 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  28.16 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  31.53 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  31.17 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
146 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
137 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  31.11 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
154 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  28.32 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  31.11 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  31.11 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  31.11 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  31.11 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  31.11 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>