105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0960 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  53.49 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  56.49 
 
 
156 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  51.05 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
143 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 
145 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  46.38 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 
142 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  54.62 
 
 
148 aa  123  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  53.79 
 
 
148 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 
140 aa  120  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 
135 aa  119  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  46.67 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  48.92 
 
 
142 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 
145 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  46.27 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 
145 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  49.29 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  49.65 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  46.38 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
142 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  45.99 
 
 
142 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  43.94 
 
 
138 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  41.61 
 
 
139 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  40.71 
 
 
141 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
147 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  43.8 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  42.42 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  39.1 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  40.44 
 
 
135 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  50.53 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  50.53 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  41.91 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
137 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  52.17 
 
 
135 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  45.87 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  48.42 
 
 
137 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.04 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
131 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.83 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
134 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  27.21 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  27.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  27.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  34.34 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 
136 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  29.75 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.74 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  31.68 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  26.8 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.19 
 
 
127 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  27.05 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  30.68 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.95 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  29.66 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  29.66 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
127 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29.36 
 
 
137 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
146 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.92 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.68 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  27.68 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  33.68 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>