79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3334 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  52.48 
 
 
160 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  51.8 
 
 
173 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 
162 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 
140 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
153 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 
144 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
144 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  33.81 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
179 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  35.35 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  27.19 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.85 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  30.59 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  33.71 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.7 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  33.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  33.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  33.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  33.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  34.83 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  34.83 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.41 
 
 
166 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.56 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  26.02 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  33.82 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
134 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
148 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  28.3 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  26.67 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
147 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.03 
 
 
135 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>