29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1303 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  45.52 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  32.59 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  34.55 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  36.62 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.62 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  36.62 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  38.67 
 
 		 154 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>