103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4479 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  89.13 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  48.51 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  48.51 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  44.53 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  37.78 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  28.68 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.61 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.16 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  30.58 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.2 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  32.06 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  32.8 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  40.79 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  24.62 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.06 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.36 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  26.72 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  28.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  27.94 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.03 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  22.81 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  22.81 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  33.07 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  25.29 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  32.56 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  28.44 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  37.29 
 
 		 149 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  24.59 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  29.36 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>