95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1590 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 162 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  80.25 
 
 		 162 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  78.4 
 
 		 173 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  82.12 
 
 		 173 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  70.13 
 
 		 160 aa  223  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  42.58 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  38.76 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 144 aa  84  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 179 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  32.39 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  39.56 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  28.1 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  36.04 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.51 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  31.5 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.38 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.74 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  37.04 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.82 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.55 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.91 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  33.65 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  36.14 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.07 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 123 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  38.81 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  35.8 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  31.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.69 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.43 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.25 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  34.58 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.83 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.69 
 
 		 152 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  28.95 
 
 		 146 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 		 128 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.8 
 
 		 165 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  30.93 
 
 		 156 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.26 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.41 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  27.46 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  26.85 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  29.17 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.19 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  35 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>