43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0492 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.11 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 137 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  28.12 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  26.24 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  27.93 
 
 		 124 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 135 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  26.92 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  25.23 
 
 		 143 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  23.45 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  24.73 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>