61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2054 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  59.18 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  38.02 
 
 		 160 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 162 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  29.69 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  30.63 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  36.26 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.27 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  27.66 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.8 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.26 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>