22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2233 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 121 aa  239  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  68.47 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  37.61 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  34.74 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  27.88 
 
 		 154 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>