100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0596 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  65.67 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  47.89 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  38.24 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  32.62 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  34.51 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  33.59 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  37.11 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  32.23 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  35.56 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  29.57 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  27.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  34.83 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  26.55 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  29.27 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.17 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  39.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.33 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.6 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  28.69 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.31 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  28.46 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  26.55 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  43.86 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  38.6 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.36 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  29.69 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 127 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  25.51 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>