211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5737 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  81.02 
 
 		 137 aa  230  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  40.94 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.93 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  31.85 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  35.24 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  31.09 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  31.09 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  26.15 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  38.38 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  28.18 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  31.01 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  32.22 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  31.68 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.68 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  33.33 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  33.71 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.96 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  36.28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  34.51 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.7 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  37.5 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 		 295 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.52 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  35.79 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  30.3 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>