119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1883 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  73.94 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  79.14 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  64.06 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  60.15 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  32.59 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  27.19 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  36.25 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  31.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  31.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  31.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  31.13 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  26.23 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.96 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 126 aa  47.4  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  29.8 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.97 
 
 		 316 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  29.8 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  29.8 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  25.17 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  29.8 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  22.81 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  32.89 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  30.46 
 
 		 374 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  22.81 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.03 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.36 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  28.74 
 
 		 295 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.41 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.73 
 
 		 126 aa  43.9  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  32.61 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  27.1 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  32.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  33.01 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  26.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  26.36 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  26.36 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 137 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.78 
 
 		 138 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  29.21 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  27 
 
 		 138 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 168 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  29.81 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  34.09 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 157 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  27.37 
 
 		 134 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 148 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>