90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0887 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  59.18 
 
 
147 aa  191  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  36.57 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32.21 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  33.05 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  27.13 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  27.27 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.58 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  35.79 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  27.93 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  45.45 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  26.52 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  34.07 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  24.48 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  29.7 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.13 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.31 
 
 
147 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.05 
 
 
154 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  25.17 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.9 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  57.14 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.44 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.44 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.44 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.95 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.37 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.09 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  24.38 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  29.09 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  24.59 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  29.01 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.46 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  26.81 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.63 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  24.74 
 
 
144 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  26.56 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  23.77 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.73 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.48 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.71 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
131 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>