143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2481 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  100 
 
 		 160 aa  320  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  57.82 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  61.31 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.05 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  56.94 
 
 		 152 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  55.97 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  57.25 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  57.35 
 
 		 147 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  51.68 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  54.68 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  55.07 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.82 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  59.23 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  56.72 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.52 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  59.23 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  58.02 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  59.84 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  53.49 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  54.74 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  53.47 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  49.03 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  51.03 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  48.05 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.71 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.55 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.35 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  51.47 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  51.52 
 
 		 141 aa  131  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.76 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  48.91 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.76 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.41 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.76 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.38 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.86 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  56.2 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  48.18 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.86 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.18 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.38 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.06 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.48 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.48 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  50.82 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.73 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.15 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  47.92 
 
 		 251 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  56.56 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.92 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.92 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  49.62 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  49.29 
 
 		 143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  50.98 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  47.24 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  47.24 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.89 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.3 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  52.94 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  47.24 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.46 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  53.68 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.46 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.46 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.46 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  52.63 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21410  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.13 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.84 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  42.73 
 
 		 199 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.13 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  35.34 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.96 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  36.94 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.68 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  36.21 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  35.71 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  37.72 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.04 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1013  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  34.86 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.14 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.68 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 121 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>