178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3246 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  75.14 
 
 		 156 aa  250  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.75 
 
 		 138 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.35 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.18 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.9 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.22 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.93 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.01 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.46 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  34.59 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  40.83 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.88 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.71 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.35 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.2 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  36.71 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  36.71 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.71 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  40.37 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.37 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.51 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.2 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.28 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.86 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.33 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.74 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.33 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  45.13 
 
 		 146 aa  90.9  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.71 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  39.17 
 
 		 251 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.98 
 
 		 146 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  36.08 
 
 		 148 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.27 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.98 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.02 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.17 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.17 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.98 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.29 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.37 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.34 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.45 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.83 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.33 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  40.95 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.83 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.28 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.98 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.98 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.2 
 
 		 146 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.53 
 
 		 151 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.07 
 
 		 141 aa  84.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  37.76 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.14 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.13 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.25 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.12 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.14 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.21 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.37 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.57 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.18 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.75 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  32.77 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  39.76 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  39.76 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  30.4 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  32.58 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 		 130 aa  50.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  33.03 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  29.31 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  29.31 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  30.63 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 127 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 		 127 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>