127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1013 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1013  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 129 aa  256  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  37.96 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  37.96 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.96 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  37.96 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.51 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.19 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.89 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.4 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.94 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.11 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.34 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.65 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.36 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.61 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.51 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  36.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.17 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.04 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.26 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.64 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.55 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.06 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2404  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.04 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.671288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.7 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.38 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.19 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.56 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.86 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  32.73 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  33.61 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0637  hypothetical protein  33.7 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0764989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.73 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.7 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0934  hypothetical protein  33.7 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  36.9 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.35 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.63 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  38.26 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  32.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.46 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  29.06 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.43 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.57 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  26.96 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  28.7 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.03 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.1 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.89 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>