31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1871 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 178 aa  355  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.88 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  28.28 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  35 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  27.72 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  32.1 
 
 		 124 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  33.91 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  30.91 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  36.08 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>