53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5020 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  293  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  42.19 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  32.37 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  30.08 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  28.57 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  32.61 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  28.79 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  31.71 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.93 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.44 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  36.47 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.8 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  24.21 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.14 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.94 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  37.66 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>