84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1853 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  290  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  98.62 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  80.67 
 
 		 166 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  37.31 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  35.76 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  35.86 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  41.79 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  36.8 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  29.85 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.5 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  24.82 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  27.64 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  39.73 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  31.18 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  31.96 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  24.22 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  26.02 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  25.62 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.13 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  35.45 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  32.71 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  34 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  26.32 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  24.19 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 		 131 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>