48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1431 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 
142 aa  246  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  45 
 
 
142 aa  120  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  25.51 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  29.27 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  26.52 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  30.85 
 
 
226 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  25.74 
 
 
156 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  23.29 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  41.43 
 
 
166 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  26.56 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  42 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  24.37 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  21.1 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
219 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  33.82 
 
 
661 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  28.92 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>