109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1536 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  45.18 
 
 
170 aa  149  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
146 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
157 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
134 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  35.64 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  32.71 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  32.82 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  31.45 
 
 
203 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  29.37 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  29.91 
 
 
226 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
131 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
239 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  31.62 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  28.08 
 
 
179 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 
237 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  31.03 
 
 
318 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  26.02 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  33.06 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  29.17 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  29.09 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
256 aa  47.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  28.1 
 
 
211 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  29.21 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
170 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.49 
 
 
135 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  39.76 
 
 
661 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  29.09 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  32.91 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  32.91 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  27.93 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  34.18 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  32.5 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.89 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
225 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  32.46 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  32.91 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17555  predicted protein  42.62 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>