75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2736 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  53.88 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  49.5 
 
 
233 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  49.5 
 
 
210 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  49.5 
 
 
233 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  50.54 
 
 
208 aa  168  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  44.61 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  47.12 
 
 
208 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  48.24 
 
 
213 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  45.11 
 
 
189 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  41.5 
 
 
203 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  40.53 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  39.56 
 
 
211 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  39.56 
 
 
220 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  38.34 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  35.98 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  38.33 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  40.91 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
136 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
162 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
162 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  41.77 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  41.77 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  41.77 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
204 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
170 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
164 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  35.29 
 
 
162 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
134 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  33.01 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  32.17 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
136 aa  45.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  25.37 
 
 
318 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  37.04 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  25.25 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  35.62 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  25.44 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  28.57 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  28.4 
 
 
131 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  28.85 
 
 
188 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  28.9 
 
 
661 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
190 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
137 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.79 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 
155 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>