69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3885 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
157 aa  323  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  98.09 
 
 
157 aa  317  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  94.9 
 
 
157 aa  307  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
153 aa  94  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  37.88 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  34.44 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  34.46 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  32.65 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  32.65 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  36.21 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  31.97 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  29.05 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
223 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  27.1 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  30.57 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  30.57 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16376  predicted protein  27.34 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000685244  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.93 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  31.76 
 
 
226 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  32.74 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  38 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
237 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.68 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  30.14 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  36 
 
 
661 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>