More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3519 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  37.29 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  37.29 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  37.29 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  36.44 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  36.44 
 
 
159 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.68 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  35.59 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.6 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  32.23 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.16 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.93 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  30.77 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.31 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  27.05 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.04 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  33.59 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.34 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
189 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.46 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  33.04 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.46 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.79 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  37 
 
 
193 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
204 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  32.03 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  34.92 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  30.25 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  35.05 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.41 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  30.91 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.41 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.41 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.41 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  27.68 
 
 
149 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  36.25 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.05 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  28.17 
 
 
141 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  30.91 
 
 
158 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  30.25 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  30.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  30.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  30.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  30.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  37 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  30.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>