More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0258 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  81.1 
 
 		 127 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  80.31 
 
 		 127 aa  214  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  81.1 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  79.53 
 
 		 127 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  74.8 
 
 		 127 aa  200  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  72.44 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  68.64 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  68.64 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  63.79 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  55.93 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  39.32 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  36 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  37.37 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  36.8 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  33.64 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.04 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.88 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.88 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.35 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 191 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  30.65 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.6 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  37.27 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.4 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  36.26 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.28 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  34.45 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  35.16 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  35.16 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  35.16 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>