102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0759 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  271  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7775  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.59 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  32.71 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.01 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28.15 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28.15 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.48 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
136 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
184 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.4 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  29.81 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.93 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  25.41 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  27.83 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.32 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.46 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  27.93 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
213 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
191 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  29.46 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  25.2 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  26.73 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.51 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.1 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.21 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  29.29 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.71 
 
 
138 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  23.73 
 
 
126 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  27.78 
 
 
158 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
141 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  25 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
133 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.22 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  24.35 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  29.73 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  31.86 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  24.39 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  26.85 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.76 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.89 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  26.15 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  28.57 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.35 
 
 
151 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 
159 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>