16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7775 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7775  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  26.4 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  26.4 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  26.4 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  28.47 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 153 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>