141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2156 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.66 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 715 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.17 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.18 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  37.84 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  28.89 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  34.29 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.43 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  26.52 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  29.82 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  26.52 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  49.02 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.17 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  31.52 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.13 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  27.73 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.73 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.49 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.49 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.41 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  30.77 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.77 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  26.77 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  31.2 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  24.81 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  26.28 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  27.52 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.77 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.77 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>